Jusqu'au milieu du XIIIème siècle, les moines, aidés par les frères convers travaillaient directement les terres. Mais en devenant une seigneurie l'abbaye connait alors de nombreux conflits.
Les paysans s'opposent à l'abbaye à propos desterres agricoles. Le premier conflit remonte à 1284, il l'oppose à la communauté villageoise de Charpey et concerne l'utilisation des pâturages d'altitude. L'abbaye l'emporta
Quelquefois, les paysans demandent le soutien des seigneurs locaux pour des recours en justice concernant l'exploitation de telle ou telle parcelle. De plus, il y a le pape Innocent II et l'empereur Fréderic I1qui soutient et prend sous sa protection l'abbaye de Léoncel. Nina et Madhyson Loïs et Léo